Desivý objav na dne oceánu ohromil vedcov

Mariánska priekopa na dne Tichého oceánu je najhlbším miestom na Zemi, pričom jej najhlbšie miesta dosahujú takmer 11 tisíc metrov. Napriek tomu, že ide o extrémne chladné a tmavé hlbokomorské prostredie, možno tu nájsť život vrátane vírusov.

Min Wang, výskumník z Oceánskej univerzity v Číne, nedávno uverejnil v magazíne Microbiology Spectrum článok, v ktorom spolu s medzinárodným tímom výskumníkov informuje o objavení nového vírusu, ktorý bol získaný z hĺbky 8 900 metrov. Ide o bakteriofág, vírus, ktorý infikuje a replikuje sa v baktériách. Znie to desivo, ale v skutočnosti je to celkom bežné.

"Podľa našich najlepších vedomostí ide o najhlbšie známy izolovaný bakteriofág vo svetovom oceáne."

- povedal Wang, ktorý sa so svojím tímom zameriava na výskum mikrobiálneho života v najextrémnejších prostrediach Zeme. Novoobjavený fág infikuje baktérie patriace do čeľade Halomonas filum, čo je rodina baktérií, ktoré sa často vyskytujú v hlbokomorských sedimentoch a hydrotermálnych prieduchoch, gejzírom podobných otvoroch na morskom dne, ktorými prúdi horúca voda. Wang povedal, že analýza genetického materiálu vírusu, ktorú skupina vykonala, naznačuje, že v hlbokom oceáne existuje doteraz neznáma rodina vírusov.

Nový objav poskytuje ešte hlbší pohľad na rozmanitosť, evolúciu a genomické vlastnosti hlbokomorských fágov a interakcie fág-hostiteľ. Vo svojej predchádzajúcej práci výskumníci použili metagenomickú analýzu na štúdium vírusov, ktoré infikujú baktérie v morskom rade Oceanospirallales, kam patrí aj Halomonas.

V rámci novej štúdie Wangov tím hľadal vírusy z bakteriálnych kmeňov, ktoré zozbieral a izoloval Yu-Zhong Zhang, tiež výskumník na Oceánskej univerzite v Číne. Zhang študuje vlastnosti mikrobiálneho života v extrémnych prostrediach vrátane Arktídy a Mariánskej priekopy.

Genomická analýza nového vírusu, identifikovaného ako vB_HmeY_H4907, naznačuje, že je rozšírený v oceáne a má podobnú štruktúru ako jeho hostiteľ. Wang hovorí, že štúdia poukazuje na nové otázky a oblasti výskumu, ktoré sa zameriavajú na stratégie prežitia vírusov v extrémnych, izolovaných prostrediach a na to, ako sa vyvíjajú spolu so svojimi hostiteľmi.

Nový vírus je lyzogénny, čo znamená, že vstupuje do hostiteľskej bunky a replikuje sa v nej, zvyčajne bez toho, aby bakteriálnu bunku usmrtil. Pri delení bunky sa genetický materiál vírusu kopíruje a odovzdáva ďalej. Wong a jeho tím hľadajú ďalšie nové vírusy v extrémnych lokalitách, pretože im to pomôže lepšie pochopiť rozmanitý svet virosféry. Ako povedal:

"Extrémne prostredia ponúkajú optimálnu príležitosť na objavovanie nových vírusov."